Ο ρόλος ενός intercooler δεν είναι άλλος από το να κρυώσει τον αέρα που κατευθύνεται στην εισαγωγή του υπερσυμπιεστή αυξάνοντας κατά αυτό τον τρόπο την πυκνότητά του. Το intercooler του Ultra 250X λειτουργεί μέσω διπλής παροχής νερού που εισέρχεται από την τουρμπίνα καθώς επίσης από την έξοδο νερού (140ο) από το manifold της εξάτμισης. Η R&D χρησιμοποιεί ένα κιτ σωληνώσεων και κατευθύνει φρέσκο νερό στο intercooler χωρίς να χρησιμοποιεί το ζεστό νερό της εξάτμισης. Κατά αυτό τον τρόπο εξασφαλίζεται η καλύτερη ψύξη του και η αύξηση των επιδόσεων του κινητήρα στην χαμηλές και μεσαίες στροφές περιορίζοντας το φαινόμενο της προανάφλεξης (detonation) και τις δυσάρεστες συνέπειες του. Το κιτ της R&D περιλαμβάνει και μία βαλβίδα ανακούφισης για να διατηρεί την πίεση του νερού στο intercooler στα χαρακτηριστικά που ορίζει ο κατασκευαστής. Διαφορετική βαλβίδα χρησιμοποιείται με το Performer Engine kit και το Stage 1 kit. Το συγκεκριμένο κιτ, σύμφωνα με τον Bill Chapin, παίζει σημαντικό ρόλο στην ολική βελτίωση των επιδόσεων του Ultra 250X.
